Zeichen der Zeit bringt eine mysteriöse neue Bedrohung mit sich: Lincoln Clay hat es mit einer gewalttätigen Gruppe von Kultisten zu tun, genannt die Ensanglanté. Die Spieler können neue investigative Gameplay-Taktiken sowie neue Waffen und Kampffähigkeiten wie Wurfmesser und Zeitlupen-Feuern einsetzen, um New Bordeaux von der drohenden Gefahr zu befreien